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URN: urn:nbn:de:swb:90-414190

Inference of Many-Taxon Phylogenies

Izquierdo-Carrasco, Fernando

Abstract:
Phylogenetic trees are tree topologies that represent the evolutionary history of a set of organisms. In this thesis, we address computational challenges related to the analysis of large-scale datasets with Maximum Likelihood based phylogenetic inference. We have approached this using different strategies: reduction of memory requirements, reduction of running time, and reduction of man-hours.


Zugehörige Institution(en) am KIT Institut für Theoretische Informatik (ITI)
Publikationstyp Hochschulschrift
Jahr 2014
Sprache Englisch
Identifikator KITopen ID: 1000041419
Verlag Karlsruhe
Abschlussart Dissertation
Fakultät Fakultät für Informatik (INFORMATIK)
Institut Institut für Theoretische Informatik (ITI)
Prüfungsdaten 03.06.2014
Referent/Betreuer Prof. A. Stamatakis
Schlagworte Phylogenetic Inference, Maximum Likelihood, GPUs, Genomics, Large-scale datasets
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