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Extensive Regulation of Diurnal Transcription and Metabolism by Glucocorticoids

Weger, Benjamin D. 1; Weger, Meltem 1; Görling, Benjamin 2; Schink, Andrea 1; Gobet, Cédric; Keime, Céline; Poschet, Gernot; Jost, Bernard; Krone, Nils; Hell, Rüdiger; Gachon, Frédéric; Luy, Burkhard ORCID iD icon 2; Dickmeis, Thomas ORCID iD icon 1
1 Institut für Toxikologie und Genetik (ITG), Karlsruher Institut für Technologie (KIT)
2 Institut für Organische Chemie (IOC), Karlsruher Institut für Technologie (KIT)

Abstract (englisch):

Altered daily patterns of hormone action are suspected to contribute to metabolic disease. It is poorly understood how the adrenal glucocorticoid hormones contribute to the coordination of daily global patterns of transcription and metabolism. Here, we examined diurnal metabolite and transcriptome patterns in a zebrafish glucocorticoid deficiency model by RNA-Seq, NMR spectroscopy and liquid chromatography-based methods. We observed dysregulation of metabolic pathways including glutaminolysis, the citrate and urea cycles and glyoxylate detoxification. Constant, non-rhythmic glucocorticoid treatment rescued many of these changes, with some notable exceptions among the amino acid related pathways. Surprisingly, the non-rhythmic glucocorticoid treatment rescued almost half of the entire dysregulated diurnal transcriptome patterns. A combination of E-box and glucocorticoid response elements is enriched in the rescued genes. This simple enhancer element combination is sufficient to drive rhythmic circadian reporter gene expression under non-rhythmic glucocorticoid exposure, revealing a permissive function for the hormones in glucocorticoid-dependent circadian transcription. ... mehr


Volltext §
DOI: 10.5445/IR/1000063585
Originalveröffentlichung
DOI: 10.1371/journal.pgen.1006512
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Web of Science
Zitationen: 39
Dimensions
Zitationen: 44
Cover der Publikation
Zugehörige Institution(en) am KIT Institut für Biologische Grenzflächen (IBG)
Institut für Organische Chemie (IOC)
Institut für Toxikologie und Genetik (ITG)
Publikationstyp Zeitschriftenaufsatz
Publikationsjahr 2016
Sprache Englisch
Identifikator ISSN: 1553-7404, 1553-7390
urn:nbn:de:swb:90-635854
KITopen-ID: 1000063585
HGF-Programm 47.01.01 (POF III, LK 01) Biol.Netzwerke u.Synth.Regulat. ITG+ITC
Erschienen in PLoS Genetics
Verlag Public Library of Science (PLoS)
Band 12
Heft 12
Seiten e1006512
Bemerkung zur Veröffentlichung Gefördert durch den KIT-Publikationsfonds
Vorab online veröffentlicht am 12.12.2016
Nachgewiesen in Scopus
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