KIT | KIT-Bibliothek | Impressum | Datenschutz

Fuzzy tissue detection for real-time focal control in corneal confocal microscopy = Fuzzy-Gewebeerkennung für Echtzeit-Fokusregelung in der Kornea-Konfokalmikroskopie

Bartschat, Andreas 1; Allgeier, Stephan ORCID iD icon 1; Scherr, Tim ORCID iD icon 1; Stegmaier, Johannes; Bohn, Sebastian; Reichert, Klaus-Martin 2; Kuijper, Arjan; Reischl, Markus ORCID iD icon 1; Stachs, Oliver; Köhler, Bernd 1; Mikut, Ralf ORCID iD icon 1
1 Institut für Automation und angewandte Informatik (IAI), Karlsruher Institut für Technologie (KIT)
2 Karlsruher Institut für Technologie (KIT)

Abstract (englisch):

Corneal confocal laser scanning microscopy is a promising method for in vivo investigation of cellular structures, e. g., of nerve fibers in the sub-basal nerve plexus. During recording, even slight displacements of the focal plane lead to images of adjacent tissue layers. In this work, we propose a closed-loop control of the focal plane. To detect and evaluate the visible tissues, we utilize the Bag of Visual Words approach to implement a customizable image processing pipeline for real-time applications. Furthermore, we show that the proposed model can be trained with small classification datasets and can be applied as a segmentation method. The proposed control loop, including tissue detection, is implemented in a proof-of-concept setup and shows promising results in a first evaluation with a human subject.
Zusammenfassung


Download
Originalveröffentlichung
DOI: 10.1515/auto-2019-0034
Scopus
Zitationen: 2
Web of Science
Zitationen: 2
Dimensions
Zitationen: 2
Zugehörige Institution(en) am KIT Institut für Automation und angewandte Informatik (IAI)
Publikationstyp Zeitschriftenaufsatz
Publikationsmonat/-jahr 10.2019
Sprache Englisch
Identifikator ISSN: 2196-677X, 0178-2312
KITopen-ID: 1000098893
HGF-Programm 47.01.02 (POF III, LK 01) Biol.Netzwerke u.Synth.Regulat. IAI
Weitere HGF-Programme 43.23.02 (POF III, LK 01) X-Ray Optics
Erschienen in Automatisierungstechnik
Verlag De Gruyter
Band 67
Heft 10
Seiten 879–888
Projektinformation DFG, DFG EIN, MI 1315/5-1
DFG, DFG EIN, KO 5003/1-1
Vorab online veröffentlicht am 27.09.2019
Schlagwörter image classification; fuzzy segmentation; bag of visual words; microscope focal control; tissue detection
Nachgewiesen in Scopus
Dimensions
Web of Science
KIT – Die Forschungsuniversität in der Helmholtz-Gemeinschaft
KITopen Landing Page