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ModelTest-NG: A New and Scalable Tool for the Selection of DNA and Protein Evolutionary Models

Darriba, Diego; Posada, David; Kozlov, Alexey M; Stamatakis, Alexandros; Morel, Benoit; Flouri, Tomas

Abstract:
ModelTest-NG is a reimplementation fromscratch of jModelTest and ProtTest, two popular tools for selecting the best-fit nucleotide and amino acid substitution models, respectively. ModelTest-NG is one to two orders of magnitude faster than jModelTest and ProtTest but equally accurate and introduces several new features, such as ascertainment bias correction, mixture, and free-rate models, or the automatic processing of single partitions.

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Verlagsausgabe §
DOI: 10.5445/IR/1000105651
Veröffentlicht am 05.02.2020
Originalveröffentlichung
DOI: 10.1093/molbev/msz189
Scopus
Zitationen: 2
Coverbild
Zugehörige Institution(en) am KIT Institut für Theoretische Informatik (ITI)
Publikationstyp Zeitschriftenaufsatz
Jahr 2020
Sprache Englisch
Identifikator ISSN: 0737-4038, 1537-1719
KITopen-ID: 1000105651
Erschienen in Molecular biology and evolution
Band 37
Heft 1
Seiten 291–294
Vorab online veröffentlicht am 21.08.2019
Schlagworte phylogenetic model selection, high-performance computing, efficient algorithms, phylogenetic inference
Nachgewiesen in Scopus
KIT – Die Forschungsuniversität in der Helmholtz-Gemeinschaft
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