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Besser und günstiger: Volumenreduktion in der Einzelzellgenomik

Sobol, Morgan S. 1; Sturm, Gunnar 2; Kaster, Anne-Kristin 3
1 Institut für Biologische Grenzflächen (IBG), Karlsruher Institut für Technologie (KIT)
2 Karlsruher Institut für Technologie (KIT)
3 Institut für Angewandte Biowissenschaften (IAB), Karlsruher Institut für Technologie (KIT)

Abstract:

Single cell genomics (SCG) is a is a complementary method to metagenomics for exploring the genomes of uncultivated microorganisms. However, due to the minute amounts of DNA in the individual microbial cell, an amplification step is required before sequencing. Unfortunately, this reaction is notoriously costly and does not amplify all genomic regions equally well, preventing high-throughput applications and leading to incomplete and biased genomes. Here, we show a simple volume reduction approach to make SCG more feasible.


Verlagsausgabe §
DOI: 10.5445/IR/1000168704
Veröffentlicht am 22.02.2024
Cover der Publikation
Zugehörige Institution(en) am KIT Institut für Angewandte Biowissenschaften (IAB)
Institut für Biologische Grenzflächen (IBG)
Publikationstyp Zeitschriftenaufsatz
Publikationsmonat/-jahr 02.2024
Sprache Deutsch
Identifikator ISSN: 0947-0867, 1868-6249
KITopen-ID: 1000168704
HGF-Programm 43.33.11 (POF IV, LK 01) Adaptive and Bioinstructive Materials Systems
Erschienen in BIOspektrum
Verlag Springer
Band 30
Heft 1
Seiten 33–36
Vorab online veröffentlicht am 15.02.2024
Nachgewiesen in Dimensions
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