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Discrete gradients in short-range molecular dynamics simulations

Grimm, Volker 1,2; Kliesch, Tobias 1,2; Quispel, G. R. W.
1 Fakultät für Mathematik (MATH), Karlsruher Institut für Technologie (KIT)
2 Institut für Angewandte und Numerische Mathematik (IANM), Karlsruher Institut für Technologie (KIT)

Abstract:

Discrete gradients (DG) or more exactly discrete gradient methods are time integration schemes that are custom-built to preserve first integrals or Lyapunov functions of a given ordinary differential equation (ODE). In conservative molecular dynamics (MD) simulations, the energy of the system is constant and therefore a first integral of motion. Hence, discrete gradient methods seem to be a natural choice as an integration scheme in conservative molecular dynamics simulations.


Verlagsausgabe §
DOI: 10.5445/IR/1000167557
Veröffentlicht am 24.01.2024
Cover der Publikation
Zugehörige Institution(en) am KIT Institut für Angewandte und Numerische Mathematik (IANM)
Publikationstyp Zeitschriftenaufsatz
Publikationsmonat/-jahr 07.2024
Sprache Englisch
Identifikator ISSN: 1017-1398, 1572-9265
KITopen-ID: 1000167557
Erschienen in Numerical Algorithms
Verlag Springer
Band 96
Heft 3
Seiten 1189–1220
Vorab online veröffentlicht am 06.01.2024
Schlagwörter Discrete gradient, Geometric numerical integration, Molecular dynamics, Linked cell method, Parallel computing
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